La Commission Église et Société a repris son activité le 7 septembre 2007, présidée par Jean-Pierre Rive, Pasteur ERF, envoyé à la MPEF comme secrétaire général.
Elle comporte 14 membres, plus 2 représentants du Conseil de la Fédération et une invitée représentant « Justice et Paix ».
Le Président de la Fédération, le pasteur Claude Baty, siège dans cette commission.
La commission a consacré ses deux premières réunions en 2007 à la définition de ses objectifs, de sa méthode de travail et des thèmes à examiner.

• Les objectifs :
il a été convenu que la commission n’avait pas pour vocation de débattre de manière réactive à des problématiques de l’actualité immédiate. Par contre, elle devait s’attacher à approfondir des sujets présentant un enjeu important dans la durée pour nos sociétés en particulier européennes et fournir ainsi au Conseil de la Fédération des documents synthétiques pouvant faire l’objet d’une diffusion auprès des membres de l’Église ou mouvements de la Fédération. La commission peut aussi être caisse de résonance, c’est à dire recueillir des informations auprès des membres de la Fédération protestante de France, les analyser et les rediffuser avec les commentaires validés par le Conseil.

• La méthode :
Pour ce faire, il a été convenu que la commission fonctionnerait au rythme de 2 séances sur un thème :
- Une première séance avec intervention d’une personnalité qualifiée
- Une deuxième séance consacrée à l’élaboration d’un document (principalement à visée d’information et de support pédagogique pour les membres du réseau de la FPF)
Les deux séances plénières encadrent un travail d’une équipe ad hoc volontaire pour élaborer un projet de document.

• Les thèmes :
La commission se donne pour thème de travail pour le 1er semestre 2008 :
- d’une part « de la surveillance et de quelques autres problèmes au regard des raisons d’être ensemble »,
- d’autre part, des « ressources limitées, du partage des richesses, de la simplicité de vie », et elle réfléchit sur les questions de bioéthique en vue des prochaines lois.